大会期間：2016-10-10〜2016-10-10
出雲駅伝に出場するチーム一覧。
| 順位 | チーム | タイム | エントリー |
| 1位 | 青山学院大 | 02:10:09.00 | エントリー |
| 2位 | 山梨学院大 | 02:10:40.00 | エントリー |
| 3位 | 東海大 | 02:11:13.00 | エントリー |
| 4位 | 中央学院大 | 02:12:08.00 | エントリー |
| 5位 | 駒澤大 | 02:12:20.00 | エントリー |
| 6位 | 日本体育大 | 02:12:42.00 | エントリー |
| 7位 | 順天堂大 | 02:13:07.00 | エントリー |
| 8位 | 早稲田大 | 02:14:20.00 | エントリー |
| 9位 | 東洋大 | 02:14:25.00 | エントリー |
| 10位 | 帝京大 | 02:15:52.00 | エントリー |
| 11位 | 京都産業大 | 02:16:24.00 | エントリー |
| 12位 | 広島経済大 | 02:19:01.00 | エントリー |
| 13位 | 第一工科大 | 02:19:21.00 | エントリー |
| 15位 | 愛知工業大 | 02:20:26.00 | エントリー |
| 16位 | 北海道学連選抜 | 02:20:28.00 | エントリー |
| 17位 | 日本文理大 | 02:20:34.00 | エントリー |
| 18位 | 中国四国学連選抜 | 02:21:33.00 | エントリー |
| 19位 | 東北学連選抜 | 02:22:44.00 | エントリー |
| 20位 | 北信越学連選抜 | 02:25:00.00 | エントリー |
| 99位 | 関西学院大 | 00:00:00.00 | エントリー |
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